Hm... soweit ich noch weiss (ich habe TrueCrypt schon ewig nicht mehr gebraucht) wird auch in einem Container ein Filesystem aufgesetzt (ext2, ext3, ext4, ntfs, fat32 etc).
Ich hab den Verdacht, dass Du eine fat32 Partition einsetzt, damit Dein TrueCrypt-Container auch unter Windows aufrufbar ist.
Kannst Du das mal überprüfen? Denn wenn das stimmt, wäre die Erklärung für Deine Rechtprobleme schnell klar: fat32 unterstützt keine Benutzerinformationen auf den darauf abgespeicherten Dateien.
Das war mal schnell herumvermutet und wild spekuliert... hoffe, ich hab den Nagel auf den Kopf getroffen und nicht meinen Daumen